Bối cảnh của Sapphique được chia thành hai địa điểm chính: "The Realm", nơi hòa hợp nhân tạo và "Incarceron", một nhà tù cực nhỏ chứa đựng một thế giới rộng lớn, tất cả được điều khiển và giám sát bởi trí tuệ nhân tạo. Có rất ít công nghệ tiên tiến trong The Realm, vì những người cai trị The Realm đã đưa loài người quay trở lại thế kỷ 17. Finn, người đã trốn thoát khỏi Incarceron, tin rằng The Realm có chút khác biệt với Incarceron.
Câu chuyện bắt đầu với Attia, người đã giúp đỡ Finn khi bản thân không thể trốn thoát. Cô đóng vai trò là trợ lý cho một pháp sư tên là Dark Enchanter, tên thật là "Rix". Cô đi theo anh ta trong chuyến du lịch của anh ta trước khi tấn công anh ta, khiến anh ta chết, mặc dù anh ta vẫn sống sót. Ban đầu cô trở thành trợ lý của anh ta để có được chiếc găng tay của anh ta, trước đây thuộc về Sapphique, Sapient huyền thoại đã trốn thoát khỏi Incarceron. Sau đó cô đi du lịch cùng Kerio, Người anh em trong lời thề của Finn.
Trong cuộc hành trình này, bộ đôi chiến đấu với một con quái vật mười hai đầu. Sau đó họ được triệu tập bởi A.I. đang chạy Incarceron để đi đến một địa điểm có chứa vỏ hình người cho A.I. Khi đi đến địa điểm này, họ gặp một nhà trẻ cho phép họ liên lạc với Finn. A.I. muốn trốn thoát để ngắm nhìn các vì sao. Tuy nhiên, làm như vậy sẽ khiến hàng triệu tù nhân bên trong phải chết.
Trong The Realm, Finn được Claudia cho biết rằng anh vốn là Giles, một hoàng tử được cho là đã chết. Anh ta có những ký ức thoáng qua nhưng không thể nhớ hết được. Sau đó, một người khác tuyên bố rằng họ là Giles. Cả hai được gọi đến trước một hội đồng để xác định ai thực sự là Giles, nơi hội đồng quyết định rằng kẻ giả danh thực sự là Giles và Finn sẽ bị xử tử vì tội nói dối, mặc dù Finn là Giles thật. Cả hai đấu tay đôi, nhưng Finn bắn trượt cú đâm vào trái tim của kẻ mạo danh.
Finn và Claudia chạy đến quản giáo, nơi đóng vai trò như một cánh cổng dẫn vào Incarceron. Từ trong căn phòng này, cả hai chống đỡ đội quân của Nữ hoàng. Jared, người cố vấn của Claudia, gặp hai người trong trại giam, suýt bị giết bởi một âm mưu ám sát. Jared biết nhiều về cổng hơn họ và bắt đầu làm việc để nó hoạt động.
Trong khoảng thời gian này, Rix, người sống sót sau sự phản bội của Attia, nhận Kerio làm người học việc, sau đó Keiro đến được lớp vỏ hình người. Rix định giết Attia để trả thù nhưng bị Kerio ngăn cản. Keiro quyết định không đưa chiếc găng tay cho A.I. mà tự mình đeo nó vào. Điều này dẫn đến việc Kerio trao đổi địa điểm với Claudia, người vẫn đang ở trong quản giáo. A.I. Incarceron đang điều hành nhận ra Claudia là Người quản lý đã loại cô khỏi Incareron để cô có thể trở thành Nữ hoàng. Kerio, lúc này đang ở bên ngoài, bị mắc kẹt giữa một trận chiến.
Nhóm bắt được con trai của Queen, buộc cô phải dừng cuộc tấn công của mình. Một số binh lính của Nữ hoàng tìm cách vào được bằng cách đi theo Sói Thép, người đóng vai trò là người bảo vệ cho Người cai ngục. nhưng không đánh bật được Finn và nhóm của anh ta. Vương quốc bất ngờ lộ ra một ảo ảnh bao trùm một thế giới đang suy tàn theo sau cỗ máy duy trì ảo ảnh đang mất đi sức mạnh. Jared sau đó lấy chiếc găng tay từ Kerio và nhận ra rằng anh ta chính là Sapphique. Jared, bây giờ là Sapphique, mở ra một cánh cổng vĩnh viễn giữa The Realm và Incarceron. Attia lần đầu tiên bước ra khỏi Incarceron qua cánh cổng và bị các vì sao đánh thức. Finn và Sapphique sau đó cam kết cải tổ cả Vương quốc và Incarceron.
